Nos dias 28 a 30 de Setembro de 2000 realizou-se, na Faculdade de Letras da Universidade de Coimbra, o XVI Encontro Nacional da APL. Nele foram eleitos os novos corpos gerentes da Associação com os seguintes elementos:

• Direcção:
  Presidente: Maria Helena Mira Mateus
  Vice-Presidente: Clara Nunes Correia
  Tesoureiro: João Costa
  Secretária: Maria João Freitas
  Secretária: Anabela Gonçalves 
• Mesa da Assembleia Geral:
  Presidente: Inês Duarte
  Vice-Presidente: Fátima Oliveira
  Secretária: Isabel Pereira
  Secretária: Marina Vigário 
• Conselho Fiscal:
  Presidente: Ana Maria Brito
  Vogal: Maria Armanda Costa
  Vogal: Teresa Brocardo 

No âmbito do Encontro decorreu o Colóquio Português Europeu e Português do Brasil – Unidade e Diversidade na Passagem do Milénio coordenado por João Peres (Univ. de Lisboa) e Mary Kato (Univ. de Campinas).
Durante o Encontro foram lançados os dois volumes de actas do XV Encontro da Associação Portuguesa de Linguística organizados por Rui Vieira de Castro e Pilar Barbosa.
Durante o Encontro foi ainda lançado o volume das actas do colóquio sobre Crioulos de Base Lexical Portuguesa realizado em Abril de 98 na Faculdade de Letras de Lisboa e promovido pela APL.

Em Janeiro de 2001 foi publicado o nº 33 do BI. A partir deste número o BI começou a ser enviado electronicamente para os associados e a página da APL passou a ser www.fsch.unl.pt/clunl/apl.

Nos dias 8 a 11 de Abril de 2001 realizou-se, na Universidade do Minho, o 24th Glow Colloquium (Generative Linguistics of the Old World) co-organizado pela APL e pela Universidade do Minho, pela Universidade Nova de Lisboa e pela Universidade do Porto. No colóquio participaram 100 investigadores nacionais e estrangeiros. Para além do Glow Colloquium realizaram-se, na Universidade do Porto, dois workshops sobre Variação e Mudança Linguística e Anáfora Nominal e Temporal.

Em Maio de 2001 publicou-se o nº 34 do BI. Durante este ano foi publicado o volume de actas do Encontro de Primavera de Maio de 2000 sobre Linguagem e Cognição: a Perspectiva da Linguística Cognitiva, uma co-edição da APL e da Faculdade de Filosofia da Universidade Católica Portuguesa, Braga.

No âmbito do Ano Europeu das Línguas, a APL organizou o Encontro As Línguas da Península Ibérica, que decorreu entre 9 e 11 de Julho de 2001, no Convento da Arrábida.

De 14 a 16 de Setembro teve lugar, em Palmela, o colóquio GALA 2001 (Generative Approaches to Language Acquisition) que contou com a participação de 100 investigadores nacionais e estrangeiros. Foram apresentadas 50 comunicações, 20 posters, e três conferências plenárias a cargo de Teresa Guasti (Univ. de Milão), Anne Christophe (CNRS) e Paula Fikkert (Univ. Católica de Nijmegen). O colóquio foi co-organizado pela APL e pelas Universidades de Lisboa e Nova de Lisboa.